全部分类
宏基因组
微生物组能够筛选出菌群结构差异与丰度差异，以及功能差异，代谢组则是菌群与宿主相互作用的直接反映，两者相辅相成。二者联合，可以更好的了解微生物菌群如何通过菌群代谢及与宿主共代谢来影响宿主的代谢状态。
扩增子
微生物组能够筛选出菌群结构差异与丰度差异，以及功能差异，代谢组则是菌群与宿主相互作用的直接反映，两者相辅相成。二者联合，可以更好的了解微生物菌群如何通过菌群代谢及与宿主共代谢来影响宿主的代谢状态。
代谢组+蛋白组
蛋白质组学可以对样品之间的蛋白质水平的变化进行定量比较，代谢组学检测样本中所有代谢物，通过蛋白组和代谢组联合分析，可系统全面地解析生物分子功能和调控机制。
代谢组+重测序
mGWAS(metabolome Genome-Wide Association Study)：代谢物的种类和数量在不同品种与组织中存在很大差异。利用二代测序技术获得群体材料的基因型数据(Genotype)，结合代谢组数据(Metabolome)，开展代谢物的全基因组关联分析，批量精确定位控制代谢表型(品质、功能营养分子等)相关候选基因，挖掘调控营养和品质等相关代谢通路机理，将有助于我们深入了解代谢遗传机制，加快培育优质新品种。
转录组+代谢组
转录组+代谢组，基于代谢组和转录组数据，开展表达基因（mRNA），代谢物积累的相关分析。差异积累的代谢物信息可辅助时序表达的众多基因进行“共表达”分析，构建核心调控网络，找出关键候选基因，阐述生物学现象。
转录组+蛋白质组+代谢组
转录组+蛋白质组+代谢组，对特定时期特定样本分别进行转录组测蛋白质组检测和代谢物检测。从遗传信息、蛋白功能或代谢通路阐释复杂的生物网络调控。
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